Le centre des maladies infectieuses examine en détail les causes des états fiévreux et des inflammations chez les patients ambulatoires et stationnaires. En cas de besoin, il travaille en étroite coopération avec des spécialistes de tous les domaines ainsi qu'avec les laboratoires spécialisés. Si l'origine est une infection, une maladie d'origine bactérienne, parasitaire, fongique ou virale, un traitement ciblé et adapté à la situation du patient est appliqué. Ces infections compliquées ne peuvent être traitées qu'avec des médicaments administrés sous forme intraveineuse. Dans la mesure du possible, ces traitements sont réalisés sous forme ambulatoire (par ex. borréliose de Lyme).
L'accent est mis sur le traitement des maladies virales et bactériennes telles que hépatites B et C, herpès, VIH/SIDA ou infections des valves cardiaques (endocardite), peau (abcès récidivants), os (ostéomyélite), corps étrangers (infections de prothèses), poumons (pneumonies, tuberculose), infections systémiques (par ex. borréliose de Lyme, syphilis), ainsi que sur le traitement des infections avec des pathogènes multirésistants.